В. Путин утвердил перечень из 41 государственных программ, в котором Росрыболовство участвует в семи

Росрыболовство является ответственным исполнителем государственной программы "Развитие рыбо­хозяйственного комплекса". Основные направления реализации данной программы включают: повышение эффективности государственного управления в сфере рыбного хозяйства, повышение эффективности контроля и надзора за водными биологическими ресурсами и средой их обитания, обеспечением безопасности мореплавания судов рыбопромыслового флота и аварийно-спасательных работ в районах промысла при осуществлении рыболовства, создание современной производственно-технологической базы, включая строительство и модернизацию судов рыбопромыслового флота, развитие береговой инфраструктуры, в том числе морских портов (в части, касающейся обслуживания судов рыбопромыслового флота), а также производства и реализации рыбной продукции, повышение качества рыбной продукции, повышение эффективности государственной поддержки рыбохозяйственного комплекса, развитие международного сотрудничества в области рыболовства, рыбоводства (аквакультуры) и товарного рыбоводства, реализация федеральной целевой программы "Повышение эффективности использования и развитие ресурсного потенциала рыбохозяйственного комплекса в 2009 - 2014 годах".

Кроме того, Росрыболовство является соисполнителем 6 государственных программ: "Развитие образования", "Обеспечение качественным жильем и услугами ЖКХ населения России", "Развитие науки и технологий", "Обеспечение обороно­способности страны", "Региональная политика и федеративные отношения", "Социально-экономическое развитие Дальнего Востока и Байкальского региона".